Metodologia de pesquisa é um tema considerado importante na formação de professores e pesquisadores e tem-se discutido sobre a adequação e pertinência de abordagens quantitativas e qualitativas no ensino de Ciências. Este texto procura ir além dessed ebate e das controvérsias a ele vinculadas, apresentando exemplos de abordagens metodológicas que vêm sendo empregadas por grupos de pesquisa brasileiros que têm contribuído para o crescimento da pesquisa em ensino de Ciências no país.