José Manuel Martins Lopes nasceu em 1958, em Vilar Formoso. Entrou na Companhia de Jesus em 1983, tendo sido ordenado sacerdote em 1994. É licenciado em Direito, em Filosofia, em Teologia e em Pedagogia. Obteve, em 2002, o doutoramento em Ciências da Educação na Universidade Pontifícia Salesiana, em Roma, tendo sido bolseiro da Fundação para Ciência e a Tecnologia. É docente da Faculdade de Filosofia da Universidade Católica Portuguesa, em Braga.